根据张尧学发来的声明，透明桌面项目组在研发过程中遵循开源代码重用协议GPL V2，使用了部分开源代码，“这是一种合法的使用，也是软件行业公认的一种合理使用，不是‘抄袭’，更非‘盗用’”。声明称，目前透明桌面系统仍在研发之中，项目组承诺将继续遵循开源代码重用协议，会有步骤有计划地开放项目源代码。
声明还表示，目前网络上出现的“抄袭”、“盗用”、“剽窃”等指责严重缺乏事实依据，已对项目组造成了极大伤害，产生了恶劣的影响，项目组成员保留依法予以追诉的权利。
张尧学并未参与透明桌面研究
昨晚，“透明桌面”项目组召开新闻发布会，对目前的“抄袭”指责进行回应。
该项目组负责人黄斌解释，“透明桌面”只是一个应用原型，是从2013年才开始做的，并没有报奖最高科技奖，而张尧学报奖的内容是他此前在清华所做的理论研究。张尧学本人并没有参与透明桌面的研究。
黄斌说，因为张尧学报奖的是理论成果，而不是完全已经实现的应用，因此申请的是国家自然科学奖，而不是技术进步奖。
黄斌解释，其操作符合目前软件行业开源代码的使用规范，“GPL协议指的是开源代码有一个公约，很多做软件的把代码开放出去，让别人能用，但是要有声明，要遵照重用协议。”他说，其项目采纳了GPL开源代码程序的一部分，是可以合理合法使用的，而目前因为还在原型开发过程中，尚未开放源代码，但之后一定会遵守重用协议，有计划地开放源代码。
“所谓的盗用，抄袭，就是某些商业机构用各种手段把代码拿到，不经许可，这才是盗用，我们是以完全合理合法的方式在使用源代码。”黄斌说，“这种指责已经给我们项目组带来了很大的伤害。”
对于目前业内对张尧学及其理论研究在获奖价值上的质疑，黄斌说，这由国家自然科学奖的评委判定，自己不好评说。
“抄袭”事件回放
2月2日 KraneSun
发帖称，中国工程院院士、清华大学教授、中南大学校长张尧学获得2014年度国家自然科学一等奖的项目实为“远程桌面项目”(Remote-desktop-client)，涉嫌抄袭国外IT工程师lordan iordanov上传的开源代码软件。
2月2日 lordan iordanov
发表声明：诸位，我想说我太、太、太感谢你们发现、跟踪、传播，并让我知道此事，不论情况如何，我的项目得到如此负有盛名的奖项，这是个巨大的荣誉……项目完全由本人业余时间完成。
2月2日 方舟子
在其个人网站及自媒体客户端发帖称，张尧学团队的“透明计算机桌面系统”的客户“盗用了开源软件”。同时，方舟子也贴出了该开源代码原开发者lordan iordanov的英文声明。
2月3日 张尧学
回应称，展示的视频是“透明桌面系统”，我获奖的项目是“网络计算的模式及基础理论研究”，获奖的研究跟展示的应用没有关系，展示的应用是为了让大家能看懂。透明桌面项目组在研发过程中使用了部分开源代码，这是一种合法的使用，也是软件行业公认的一种合理使用，不是“抄袭”，更非“盗用”。
