南师大珍稀动物标本博物馆：
有约千种动物标本
地点：南师大仙林校区
开放时间：需团体预约
这是目前江苏省面积最大、品种最全、数量最多，也是南京对外展出的大型动植物博物馆之一。二楼水生动物园区，陈列着最珍贵的白鳍豚标本。目前馆藏标本包括许多水生哺乳动物、两栖爬行动物、昆虫、菌物等模式标本。
南农中华农业文明博物馆：
中国最早的农业文明博物馆
地点：南农大校园南侧
开放时间：团队参观需预约
最大名鼎鼎的莫过于明嘉靖刻本《齐民要术》。它是我国现存最早的最完整的农书，位居中国五大农书之首。目前国内仅有两部。馆内还收藏有崇祯平露堂刻本《农政全书》、明刻本《唐宋白孔六帖》和《花史左编》等善本古籍。
南京航空航天博物馆：
国宝级“歼-12”战机
地点：南航明故宫校区
开放时间：无具体开放时间
这里的藏品，部分为全国独有。其中一架被誉为“空中李向阳”的“歼-12”战机可是国宝级的珍品。它由我国自主研发，至今还是世界上“最轻”的超音速战斗机——空机重量只有3100千克。
南京中华指纹博物馆：
收藏有远古人类指纹
地点：江苏警官学院安德门校区
开放时间：需要提前预约
该馆实物藏品6000多件,从远古时代陶器上人类祖先留下的指纹,到清朝光绪年间审讯记录上留下的革命党人指纹。1915年,孙中山先生在自己的天字壹号中华革命党党证左下角按下了手印。
